Dec 21, 2025
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La herramienta fue publicada en la revista científica PLOS Computational Biology.
Un software español permite identificar redes genéticas ocultas del cáncer
La herramienta fue presentada en la revista científica PLOS Computational Biology.
Investigadores de la Universidad de Navarra han desarrollado Rnacorex, una innovadora herramienta de código abierto destinada a identificar redes reguladoras de genes relacionados con el cáncer y distribuir a los pacientes según su probabilidad de supervivencia.
El programa fue diseñado por expertos del Instituto de Ciencia de Datos e Inteligencia Artificial y del Centro Clínico Oncológico Universidad de Navarra.Para comprobarlo, los científicos utilizaron datos del Consorcio Internacional The Cancer Genome Atlas (TCGA), que recopila información genética de trece tipos diferentes de tumores, entre ellos los de mama, colon, pulmón, estómago, melanoma y cabeza y cuello, como señala la Universidad de Navarra.
La herramienta fue publicada en la revista científica PLOS Computational Biology.Como se detalla en la publicación, RNACOREX permite el análisis de miles de moléculas juntas para identificar interacciones importantes entre microARN y ARN informadores.Estas interacciones, que a menudo los enfoques comunes pasan por alto, son esenciales para construir redes regulatorias que sean interpretables y útiles en el contexto del análisis de supervivencia.
Rubén Armañanzas, investigador principal del Laboratorio de Medicina Digital DATAI, explicó que RNACOREX integra bases de datos internacionales con información real sobre expresión génica.Gracias a ello, el sistema es capaz de priorizar aquellas interacciones de importancia biológica y construir modelos de posible complejidad creciente.
El estudio muestra que RNACOREX logra un rendimiento de predicción igual o incluso mejor que los modelos de IA más avanzados.A diferencia de estos últimos, los modelos de "caja negra", esta herramienta proporciona una interpretación clara de los mecanismos moleculares implicados en cada predicción.Así lo destacó Aitor Oviedo-Madrid, el primer firmante del artículo, quien señaló que el software proporciona explicaciones transparentes de las interacciones que respaldan las estimaciones de supervivencia.
RNACOREX está disponible en las plataformas GitHub y PyPI, lo que facilita su implementación en diferentes entornos de investigación.Además, incluye la posibilidad de descargar automáticamente las bases de datos necesarias, lo que simplifica su uso para científicos de todo el mundo.
La investigación de Rnacorex es consciente de que puede describir las sesiones de OPQUQUE y mostrar instrucciones progresivas para enseñar el patrón y los proyectos progresivos.El empleador está abierto a las puertas para solicitudes sobre las profundidades del gerente y el desarrollo de planes personales.
